Der opstår meget sjældent komplikationer i forbindelse med pacemakeranlæggelse og pacemakerskift.
Der kan i sjældne tilfælde opstå blødning eller infektion i pacemakerlommen.
Pacemakerledningen (-erne) kan miste forbindelsen med hjertemusklen. Det sker som regel kort tid efter indgrebet, og i så fald må ledningen (-erne) lægges om.
Endnu sjældnere kan der opstå luft mellem lungehinderne, som kan kræve drænanlæggelse.
En yderst sjælden komplikation er perforation af hjertehinden - det vil sige en rift eller et hul i hjertehinden. Sker dette, kræver det, at blodet bliver udtømt.