Årsagen kan variere alt efter, hvilken type det er. Sygdommen opstår som regel i mitralklappen eller aortaklappen og opdeles i, om det er forsnævring eller utæthed.
Den mest almindelige hjerteklapsygdom er aortastenose, som betyder forkalkning/forsnævring af aortaklappen, der sidder mellem venstre hjertekammer og hovedpulsåren (aorta).
Ved forsnævring er hjerteklappen vokset sammen og nogle gange forkalket. Det betyder, at klappen ikke kan åbne sig tilstrækkeligt. Hullet gennem klappen bliver for lille, og blodet har svært ved at komme igennem. Årsagen hertil er ofte alderdom eller en følgevirkning til en infektion i hjerteklappen. Tilstanden kan også være medfødt.
Ved utæthed kan hjerteklappen ikke lukke tæt. Det betyder, at en del af blodet løber den forkerte vej. Årsagen hertil kan variere. Det kan være medfødt, være en følgevirkning til infektion i hjerteklappen eller anden form for hjertesygdom såsom blodprop i hjertet eller forstørret venstre hjertekammer.